EUROPA
PRESS
4 octubre
2019
Descubren
pequeñas moléculas con efectos similares a los de fármacos en el microbioma
humano
Investigadores de la Universidad de
Princeton (Estados Unidos) han descubierto mediante un nuevo enfoque
bioinformático grupos de genes que habían permanecido ocultos en el microbioma
humano y cuyos efectos se asemejan a los de los fármacos.
El algoritmo, denominado MetaBGC, puede ser de utilidad para
la "bioprospección" de muestras de microbioma humano en busca de
genes cuyos productos proteicos presentan características como propiedades
antimicrobianas, explican en la revista 'Science'.
Si bien el microbioma humano se ha correlacionado con
diferentes enfermedades, los mecanismos y moléculas que rigen sus efectos sobre
la enfermedad permanecen mayoritariamente sin explorar.
Las investigaciones han demostrado que el microbioma puede
producir una gama de productos de moléculas pequeñas, aunque no se habían
implementado enfoques sistemáticos para descubrirlos y caracterizarlos.
En esta ocasión, Yuki Sugimoto y sus colegas de la
Universidad de Princeton han desarrollado un algoritmo computacional, el
'MetaBGC', diseñado para identificar moléculas pequeñas biológicamente activas
codificadas directamente en datos de secuenciación derivados de microbiomas
humanos.
Para probarlo, lo ejecutaron en muestras de microbioma
humano buscando una clase de molécula pequeña de la que nunca se había
informado, que son un grupo de genes biosintéticos (BGC) TII-PKS.
Los investigadores descubrieron varios BGC TII-PKS novedosos
en tres partes del cuerpo (boca, intestino y piel), lo que indica que esta
clase de moléculas está codificada en metagenomas derivados de humanos, pese a
no haberse informado de ellas en aislamientos comunes del microbioma humano.
Según informan los autores, varios de los nuevos BGC TII-PKS
encontrados tienen actividad antimicrobiana contra los microbios vecinos. En
otros estudios realizados con su enfoque y que demostraron su eficacia del
mismo, se incluyeron muestras de microbiomas humanos de personas de Estados
Unidos, Dinamarca, España, Fiyi y China, lo que da idea de que el enfoque es
generalizable.